Localización
- Edificio de apoio á investigación (CACTUS)
- Rúa de Constantino Candeira, 1. Campus Vida , 15782Santiago de Compostela
- Teléfonos
- 881 816 242
Identificación de proteínas por espectrometría de masas mediante pegada dactilar peptídica (PMF “peptide mass fingerprinting”), usando o espectrómetro de masas Maldi- TOF/ TOF (Ultraflex III TOF/ TOF de Bruker), posteriormente á súa dixestión tríptica.
A partir de proteínas en solución ou en xel, realízase un proceso de redución e carbamidometilación continuado dunha dixestión encimática con tripsina (enzima que rompe especificamente polas lisinas e arxininas, se non van seguidas dunha prolina), para obter os seus péptidos.
O dixerido tríptico analízase pola técnica MALDI-TOF da que se obtén a relación m/z dos péptidos xerados na dixestión, o que determinará a pegada dactilar peptídica desa proteína (PMF). Estas masas experimentais serán comparadas coas masas teóricas existentes nas bases de datos e a súa correlación dará lugar a unha identificación, empregando un motor de busca (PEAKS, MASCOT).
Cando a identificación por análise PMF falle, realízase unha análise mediante a técnica MALDI- TOF/ TOF. Deste xeito obterase identificación de proteínas mediante os espectros de fragmentación dalgunhas das masas dos péptidos obtidos, e a súa correlación coas bases de datos existentes.
As proteínas de baixo peso molecular (<20 KDa) poden ser difíciles de identificar, debido ao baixo número de péptidos que se obteñen da súa dixestión.
Instrumentación: ULTRAFLEX III TOF/TOF (BRUKER)
Unidade de Espectrometría de Masas e Proteómica
- Edificio de Apoio á Investigación (CACTUS)
- Rúa de Constantino Candeira, 1. Campus Vida , 15782Santiago de Compostela
- 881 816 242