Ubicación
- Edificio de Apoyo a la Investigación (CACTUS)
- Rúa de Constantino Candeira, 1. Campus Vida , 15782Santiago de Compostela
- Teléfonos
- 881 816 242
Identificación de proteínas mediante los espectros de fragmentación de algunas de las masas de los péptidos obtenidos, usando el espectrómetro de masas Ultraflex III TOF/TOF (Bruker) y su correlación con las bases de datos existentes. La fragmentación de los péptidos se puede hacer mediante la fragmentación LID (descomposición metaestable) o CID Collision-Induced Dissociation (fragmentación de alta energía).
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A partir de proteínas en solución, o en gel, se realiza un proceso de reducción y carbamidometilación continuado de una digestión enzimática con tripsina (enzima que rompe específicamente por las lisinas y argininas, si no van seguidas de una prolina), para obtener sus péptidos.
El digerido tríptico se analiza por la técnica MALDI-TOF de la que se obtiene la relación m/z de los péptidos generados en la digestión, y fragmentación de algunas de las masas de los péptidos obtenidos. Estas masas experimentales serán comparadas con las masas teóricas existentes en las bases de datos y su correlación dará lugar la una identificación, empleando un motor de búsqueda (PEAKS, MASCOT).
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Unidad de Espectrometría de Masas y Proteómica
- Edificio de Apoio á Investigación (CACTUS)
- Rúa de Constantino Candeira, 1. Campus Vida , 15782Santiago de Compostela
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