Epidemiología, Medicina Preventiva y Policía Sanitaria I

OBJETIVOS
Interés de la materia dentro de la profesión Veterinaria
Esta materia está incluida en el Módulo de Ciencias Clínicas y Sanidad Animal. El interés de esta asignatura en el Grado está asociado a la creciente importancia de la Epidemiología desde un punto de vista profesional. Debido a la legislación Europea, muy restrictiva sobre el uso de fármacos en animales, no solo para el tratamiento etiológico de las enfermedades infecciosas y parasitarias, sino también y sobre todo evitando el uso de promotores de crecimiento de origen antibiótico, la Medicina Veterinaria tiene que evolucionar hacia la Medicina Preventiva, lo que supone la presencia de un profesional no solo Veterinario Clínico, sino también Epidemiólogo. De cara al futuro de la profesión, el porcentaje de veterinarios especializados en Epidemiología necesariamente aumentará, bien como profesionales libres, contratados por cooperativas o empresas de mayor envergadura o, incluso en el futuro, en la Administración Pública, con el fin de controlar enfermedades de importancia económica (brotes que supongan el cierre de las fronteras a exportaciones a otros países que conlleven un sacrificio masivo de animales si llegan a aparecer) o de carácter zoonósico (por ejemplo, el control de la gripe aviar). Para su control, las personas más adecuadas son aquellas que hayan recibido una formación epidemiológica.
Otro punto muy importante, y cada día más, es el bienestar animal. En este punto es muy importante un conocimiento profundo de la Epidemiología y la Medicina Preventiva, sobre todo en los animales de renta, para hacer posible una explotación rentable, pero que cubra también la preocupación por la comodidad dentro de la producción.

Objetivos de la materia
- Entender el concepto poblacional, base en los estudios epidemiológicos, y su prolongación en espacio y tiempo, para poder generar programas sanitarios destinados a la Medicina Preventiva.
- Conocer los indicadores de salud y su valoración estadística, así como los determinantes de enfermedad y su cuantificación como factores de riesgo en las poblaciones.
- Conocer y entender qué mecanismos participan en la transmisión y mantenimiento de la enfermedad en una población.
- Conocer las fuentes de datos accesibles al veterinario para obtener información, así como la metodología para realizar estudios observacionales en diferentes situaciones ambientales. Además, deberá adquirir las habilidades precisas para, no solo obtener, sino también codificar, almacenar y analizar estadísticamente toda la información.
- Conocer y comprender la aportación de la epidemiología a la lucha frente a las enfermedades y sus posibilidades de modelización y prevención, así como su aportación en relación a la salud pública.
- Adquirir la terminología adecuada de la materia que se imparte.
- Aprender a planificar programas sanitarios y productivos con el fin de rentabilizar las explotaciones ganaderas.
Con estos objetivos pretendemos cubrir algunos de los objetivos Generales del Título de Graduado en Veterinaria por la Universidad de Santiago de Compostela, algunos de las cuales podrían ser tomadas como definición de esta materia.

El programa de esta materia abarca 3 bloques temáticos, sesiones interactivas, prácticas clínicas y 1 hora de tutoría.
BLOQUE 1: Introducción y perspectiva histórica. Conceptos básicos. Poblaciones. Determinantes de la enfermedad. Transmisión y mantenimiento de la enfermedad. Formas de la enfermedad. Programas sanitarios y productivos. Bioseguridad y monitorización. Probabilidad.
Tema 1. Desarrollo histórico y perspectivas de futuro. Objetivos y definición de la Epidemiología y Medicina Preventiva. Aplicación de la Epidemiología a los programas de gestión de la Sanidad animal y la Producción. Horas expositivas: 1 h.
Tema 2. Concepto de población. Causalidad. Concepto de causa. Postulados de Koch, Hill y Evans. Modelos causales. Causas necesarias y suficientes. Determinantes. Triada epidemiológica. Tipos de presentación de la enfermedad. Métodos de transmisión. Horas expositivas: 4 h.
Tema 3. Elementos y diseño de los programas sanitarios y productivos. Bioseguridad. Actuaciones sanitarias. Monitorización y seguimiento de la productividad. Productividad subóptima y sus causas. Horas expositivas: 3 h.
Tema 4. Probabilidad. Aleatoriedad. Cálculo de la probabilidad. Horas expositivas: 2 h.

BLOQUE 2. Muestreo. Diagnóstico. Medidas epidemiológicas. Fuentes; tipos de datos y su obtención.
Tema 5. Muestreo. Métodos de muestreo. Muestreos no probabilísticos y probabilísticos. Determinación del tamaño muestral. Horas expositivas: 2 h.
Tema 6. Tipos de medidas epidemiológicas: razones, proporciones y tasas. Medida de la frecuencia de la enfermedad: prevalencia e incidencia. Tasa de morbilidad, mortalidad, letalidad y ataque. Estandarización de tasas. Horas expositivas: 2 h.
Tema 7. Diagnóstico. Validación de una prueba diagnóstica. Concordancia. Estadístico de Kappa. Sensibilidad. Especificidad. Valores predictivos. Relación con la prevalencia. Horas expositivas: 3 h.
Tema 8. Diseño de estudios epidemiológicos. Introducción. Fuentes de datos en epidemiología. Criterios de clasificación. Estudios observacionales: transversales, caso-control, cohortes. Estudios experimentales. Horas expositivas: 3 h.
Tema 9. Elaboración de cuestionarios. Tipos de encuestas. Variables utilizadas. Horas expositivas: 2 h.

BLOQUE 3. Análisis y exposición de datos.
Tema 10. Estadística descriptiva. Introducción. Distribución de frecuencias. Estimadores de posición y dispersión. Intervalos de confianza. Representación gráfica. Horas expositivas: 2 h.
Tema 11. Estadística analítica. Introducción. Pruebas para detectar diferencias. Pruebas para detectar correlaciones. Pruebas para detectar asociaciones. Horas expositivas: 2 h.
Tema 12. Epidemiología estadística. Medidas de asociación e impacto. Introducción. Estimadores de riesgo: riesgo relativo; riesgo atribuible, fracción etiológica, odds ratio. Horas expositivas: 1 h.
Tema 13. Concepto de confusión e interacción. Técnicas para el control de la confusión. Horas expositivas: 1 h.

SESIONES INTERACTIVAS Y CLÍNICAS
Epidem. OR1 - 4 horas (Sala de informática).
Se explicarán las razones que hacen que el ordenador sea una herramienta fundamental en muchas de las ciencias que se explican en el grado de Veterinaria, y en concreto, en Epidemiología y Medicina Preventiva.
A continuación, los estudiantes recibirán a través de la plataforma virtual un fichero de datos en formato ods. Usarán una hoja de cálculo GPL Calc y/o Gnumeric y se mostrará la forma de introducir los datos de manera que puedan usados en R. Se mostrará también como hacer gráficos y el uso de fórmulas en las hojas de cálculo. El software utilizado es GPL, para que los estudiantes puedan instalarlo en sus ordenadores personales y repetir y mejorar su uso de forma autónoma.
Esos datos se tranformarán para poder ser introducidos en el paquete estadístico R (también software libre, con el mismo fin que los anteriores)

Epidem. C2 - 4 h (Sala de informática).
La mayor complicación de esta sesión es que la mayor parte de los estudiantes no están acostumbrados a usar el terminal y a redactar comandos para realizar las rutinas en sus ordenadores y hay que enseñarles a no cometer errores en la sintaxis del lenguaje R. Por eso utilizamos en un inicio R y luego RStudio, donde el editor de comandos hace más sencillo el uso. En esta sesión los estudiantes aprenderán a manejar los datos de producción y sanitarios de los ordenadores de las explotaciones y analizarlos. Estos datos serán introducidos en el sistema estadístico R y los estudiantes aprenderán los conceptos de objeto, función, comando y manejo de datos en R. Inicialmente se tratará sobre el manejo de datos y estadística descriptiva, así como la realización de gráficos. Luego iniciaremos el análisis estadístico, poniendo ejemplos para el cálculo de muestreos representativos, sensibilidad, especificidad y el estadístico de Kappa. Luego se realizará una prueba que se entregará en una actividad de la plataforma virtual de la USC para ser evaluada (valor 20 puntos).

Epidem. C3 - 4 h (Sala de informática).
En esta segunda sesión clínica se aplicarán en los ordenadores los comandos fundamentales para la realización de la estadística analítica en R y RStudio
Pruebas de diferencia: t de Student y Anova
Pruebas de asociación: Chi cuadrado
Pruebas de relación: correlación y regresión

Epidem. OR2 - 4 h. (Sala de informática).
Dentro de la evaluación continua, los estudiantes se les dará una serie completa de datos (reales o ficticios) con los que tendrán que resolver una situación, determinando la causalidad de un problema, demostrarlo estadísticamente, detectar las posibles variables confusoras y presentar un informe con las posibles soluciones que deberán subir a la plataforma virtual de la USC para ser evaluada (valor 60 puntos).

La asistencia a las sesiones interactivas y prácticas clínicas es obligatoria. Los estudiantes que no asistan no podrán aprobar la materia en ese curso académico.

TUTORÍAS (1 h.)
Los estudiantes tendrán una hora de tutoría.
En ella se les planteará a los estudiantes la realización de dos pruebas que se realizarán en la Epidem. C3 y la Epidem. OR2, relacionados con los temas que va a dar cada uno de los profesores y luego atender a las dudas surgidas y poder solucionarlas antes de que se realicen y entreguen por la plataforma virtual.

BERTHOLD, M.R.; BORGELT, C.; HÖPPNER, F.; KLAWONN, F. (2010). Guide to Intelligent Data Analysis. Springer-Verlag London Limited.
CONTRERAS, A; SÁNCHEZ, A.; CORRALES, J.C. (2001). Epidemiología veterinaria. Univ. Murcia.
DOHOO, I.; MARTIN; W., STRYHN, H. (2009). Veterinary Epidemiologic Research. Segunda edición. VER Inc., Charlottetown, Canada.
DURR, P.; GATRELL, A. (2004). GIS and spatial analysis in veterinary science.CAB International, Wallingford, Oxfordshire, UK.
GORDIS, L. (2005). Epidemiología. Tercera edición. Elsevier España, Madrid.
GREENBERG, R.S. y col. (1998). Epidemiología médica. Manual Moderno, México D.F.
HOUE, H. (2004). Introduction to Veterinary Epidemiology. BIOFOLIA.
LAST, JM. (1989). Diccionario de Epidemiología. Salvat Editores, S.A. Barcelona.
MACHIN, D., CAMPBELL, MJ., TAN, BT., TAN, SH. (2018). John Wiley & Sons Ltd, Oxford, OX4 2DQ, UK.
MORTON, E.R.; HEBEL, J.R.; McCARTER, R.J. (1993). Bioestadística y epidemiología. 2ª edición. McGraw-Hill, México, D.F.
ORTEGA, C. y col. (1995). Manual de Epidemiología aplicada para el veterinario clínico. Esteve Veterinaria, Barcelona.
PETRIE, A.; WATSON, P. (1999). Statistics for veterinary and animal science. Blackwell Science, Ltd., Oxford.
PFEIFFER, D.U. (2010). Veterinary Epidemiology. An Introduction. Wiley-Blackwell.
PFEIFFER, D.U. (2008). Spatial Analysis in Epidemiology. Oxford University Press
ROTHMAN, K.J. (2012). Epidemiology. An introduction. Second edition. Oxford University Press, New York.
ROTHMAN, K.J., GREENLAND, S.; LASH, T.L. (2008). Modern Epidemiology. Third edition. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, USA.
STUART, A. (2002). Ideas básicas de muestreo científico. Editorial A.C., Madrid.
THRUSFIELD, M. (2005). Veterinary Epidemiology. Third Edition. Blackwell Scientific Publications Ltd., Oxford.
VERZANI, J. (2011). Getting Started with RStudio. O'Reilly.

Páginas Web
http://aeema.vet-alfort.fr/
http://ccp.ucr.ac.cr/cursos/epidistancia/contenido/4_epidemiologia.htm
http://www.bettycjung.net/Bite.htm
http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Epidemiology
http://www.answers.com/topic/epidemiology
http://www.fao.org
http://www.woah.org/es/inicio
http://www.quadernodiepidemiologia.it/epi/HomePage.html

BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA sobre el paquete R:
http://cran.r-project.org/doc/contrib/Owen-TheRGuide.pdf
http://cran.r-project.org/doc/contrib/Paradis-rdebuts_en.pdf
http://cran.r-project.org/doc/contrib/Verzani-SimpleR.pdf
http://cran.r-project.org/
http://cran.r-project.org/faqs.html
http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf
http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-data.pdf
http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.pdf
http://cran.r-project.org/doc/contrib/rdebuts_es.pdf

Competencias Generales
GVUSC01. Capacidad de aprendizaje y adaptación.
GVUSC02. Capacidad de análisis y síntesis.
GVUSC03. Conocimientos generales sobre el área de trabajo.
GVUSC04. Planificación y gestión del trabajo.
GVUSC05. Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica.

Competencias Específicas
Competencias específicas disciplinares (saber)
CEDVUSC 08. Conocimiento y diagnóstico de las distintas enfermedades animales, individuales y colectivas, y sus medidas de prevención, con especial énfasis en las zoonosis y en las enfermedades de declaración obligatoria.

Específicas profesionales (saber hacer)
D1VUSC 05. Realizar estudios epidemiológicos y desarrollar programas de prevención, control y erradicación de las enfermedades animales, con especial atención a las enfermedades de declaración obligatoria y zoonosis.
D1VUSC 11. Valorar e interpretar los parámetros productivos y sanitarios de un colectivo animal, considerando los aspectos económicos, medioambientales y de bienestar, buscando su optimización.
D1VUSC 14. Realizar análisis de riesgos, incluyendo los medioambientales y de bioseguridad, así como la valoración, gestión y supervisión de sistemas de gestión de la calidad.

Competencias Específicas Académicas (querer hacer)
CEAVUSC 01. Analizar, sintetizar, resolver problemas y tomar decisiones en los ámbitos profesionales de el/la Veterinario/a.
CEAVUSC 04. Buscar y gestionar la información relacionada con la actividad de el/la Veterinario/a.
CEAVUSC 08. Ser consciente de la necesidad de mantener actualizados los conocimientos, habilidades y actitudes de las competencias profesionales mediante un proceso de formación permanente.

Competencias transversales
CTVUSC 01. Capacidad para el razonamiento y la argumentación.
CTVUSC 02. Capacidad para obtener información adecuada, diversa y actualizada por diversos medios, como información bibliográfica e Internet, y analizarla de una forma crítica.
CTVUSC 03. Capacidad para elaborar y presentar un texto organizado y comprensible.
CTVUSC 05. Habilidad en el manejo de las TICs.
CTVUSC 07. Capacidad para resolver problemas mediante la aplicación integrada de sus conocimientos.

Sesiones expositivas
Serán de carácter obligatorio, se impartirán en las aulas a un grupo completo. Su duración será aproximadamente de 50 minutos. Se proporcionará material teórico previamente a la clase para hacer posible que en la exposición a través de sistemas multimedia se puedan introducir problemas y preguntas que pongan la atención de los estudiantes en casos reales que suceden en la vida diaria en las explotaciones. Al acercarse un profesor a la finalización de un bloque o grupo homogéneo de materia, se realizarán controles de una duración aproximada de 30 minutos. No procede la dispensa a clase.

Sesiones interactivas e prácticas clínicas
Las sesiones interactivas se realizarán en las aulas de informática con grupos de 20 estudiantes, cada uno con un ordenador. En ellas los estudiantes aprenderán a manejar los datos y realizar gráficos en hojas de cálculo; posteriormente introducirán los datos en R, donde aprenderán los comandos básicos para obtener gráficos, valores descriptivos de las variables y a realizar pruebas estadísticas. No procede la dispensa a las sesiones interactivas.

Las prácticas clínicas se realizarán en grupos de 10 estudiantes; en ellas se aprenderá a extraer, manejar y analizar los datos reales de las explotaciones para tomar decisiones sobre los animales y sus enfermedades. No procede la dispensa a las prácticas clínicas.

Tutoría
La tutoría nos permitirá presentar los boletines que tienen que hacer y poder corregir los posibles errores que aparezcan en su realización.

Se realizará una evaluación continua sobre los estudiantes que se realizará de la siguiente manera:
A lo largo de las exposiciones de los temas se efectuarán 4 controles aleatorios. Se aplicarán en el momento en que un profesor termine de dar su parte en un bloque. Estos controles tienen la función de controlar la asistencia de los estudiantes y valorar su aprendizaje progresivo. Serán alrededor cinco preguntas cortas que buscarán posibles soluciones ante posibles situaciones asociadas a los temas dados. El valor total de los controles aleatorios será de 20 puntos (4x5 puntos).
Los estudiantes dispondrán en la plataforma virtual de dos boletines. Estos boletines serán similares a los que tendrán que hacer en la Epidem. C2 y Epidem. OR2. Para realizar estos boletines se les suministrará a los estudiantes un conjunto de datos relacionados con alguna enfermedad o alteración de una población animal de la que los estudiantes tendrán que descubrir la causalidad, detectar que factores están influyendo, demostrarlo estadísticamente y presentar un informe con las recomendaciones adecuadas para solucionar el problema. Los que van a ser evaluados se entregarán a través de la plataforma virtual y su valor total será de 80 puntos (20+60).
Los estudiantes que mediante los controles y boletines hayan obtenido 50 puntos, habrán superado la materia mediante la evaluación continua sin necesidad de asistir al examen teórico.
Los estudiantes que no pudieran superar la materia a través de los controles y boletines podrán realizar un examen al final del curso para poder recuperar las partes que en la evaluación continua no pudieran haber superado.
Para los casos de realización fraudulenta de ejercicios o pruebas será de aplicación lo recogido en la “Normativa de evaluación del rendimiento académico de los estudiantes y de revisión de cualificaciones”.
Cualificación final del estudiante
Se evaluará a los estudiantes de forma continua (100%). Los exames finales permitirán recuperar las partes no superadas mediante la evaluación continua. No procede la dispensa a la docencia.

Horas presenciales:
Sesiones expositivas: 28 h.
Sesiones interactivas: 8 h.
Prácticas clínicas: 8 h.
Tutorías: 1 h.
Total horas presenciales: 45 h.

Horas no presenciales:
Estudio individual: 37,5 h.
Preparación de los boletines: 20 h.
Revisión de bibliografía: 2 h.
Asistencia a charlas u otras actividades recomendadas: 1 h.
Resolución de problemas: 5 h.
Realización de exámenes (si fuera necesario): 2 h.
Total de horas de trabajo personal: 67,5 h.

Total de horas empleadas por el estudiante: 112,5 h.

Para llevar bien esta asignatura se debe comprender bien cuáles son los conceptos verdaderamente importantes, que deber ser tenidos en cuenta al preparar la materia, y que además serán de gran utilidad en otras asignaturas. La realización de las sesiones interactivas otra vez en casa puede ser de gran utilidad, y además nos ayuda a ver cómo funciona un ordenador y la red, herramientas esenciales para la Epidemiología. Para ello están colgadas en la red a través de un curso en la plataforma virtual, incluyendo todos los materiales (guías, ficheros de datos y gráficos) y pueden ser utilizados en cualquier ordenador conectado a la red, descargados etc…
Desde un punto de vista de la realización de los boletines, se recomienda a los estudiantes que no sean parcos en sus comentarios, que pueden ser de mayor valor que la resolución de un simple análisis estadístico. Es importante que utilicen los conocimientos que tienen y el sentido común para valorar los resultados obtenidos en las diferentes pruebas.

Es recomendable tener unos conocimientos básicos de Matemáticas, que se habrán impartido en la educación secundaria previa a la entrada en la Universidad, y también comprender las bases de la Estadística, que los estudiantes habrán cursado al inicio del grado. Asimismo, serán de gran utilidad un conocimiento general de informática, y más en concreto sobre hojas de cálculo, como por ejemplo Excel o Calc (manera de funcionamiento, fórmulas…) y unos conceptos básicos sobre el funcionamiento de programas estadísticos, como pueden ser SPSS, o cualquier otro tipo de programa estadístico comercial (Systat, Stata…) o gratuito, tanto freeware como de código libre, (OpenStat, R, MacAnova…).
Unos conocimientos básicos de inglés también favorecen el desarrollo de esta materia, ya que gran parte de la bibliografía no tiene traducción al español.