Ingeniería Genética

• Conocer los conceptos, terminología y metodología básicos de la Ingeniería Genética y la Biotecnología.
• Comprender las diferentes aplicaciones de la Biotecnología.
• Manejar la bibliografía especializada y exponer trabajos relacionados con la Ingeniería Genética y la Biotecnología.

Las actividades presenciales de la materia incluyen clases expositivas (26h), seminarios interactivos (6h), prácticas de laboratorio (8h), tutorías de aula (2h) y un examen final.

• CLASES EXPOSITIVAS

TEMA 1. INTRODUCCIÓN A LA INGENIERÍA GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA. (1h)
TEMA 2. ENZIMOLOGÍA DEL DNA RECOMBINANTE. PURIFICACIÓN Y ANÁLISIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS. (3h)
TEMA 3. HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS. (2h)
TEMA 4. LA PCR. (2h)
TEMA 5. CLONACIÓN DE DNA EN E. coli. (4h)
TEMA 6. GENOTECAS Y MICROARRAYS. (1h)
TEMA 7. SECUENCIACIÓN DEL DNA. (2h)
TEMA 8. MUTAGÉNESIS DIRIGIDA E INGENIERÍA DE PROTEÍNAS. (2h)
TEMA 9. EXPRESIÓN DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES EN E. coli. (2h)
TEMA 10. CONTROL DE LA EXPRESIÓN GÉNICA (2h)
TEMA 11. INGENIERÍA GENÉTICA EN LEVADURAS. (1h)
TEMA 11. INGENIERÍA GENÉTICA EN ANIMALES Y APLICACIONES (2h)
TEMA 12. INGENIERÍA GENÉTICA EN PLANTAS Y APLICACIONES (2h)


• SEMINARIOS

Seminarios 1 y 2. Cálculos básicos y problemas sobre manipulaciones de ácidos nucleicos. (2h)
Seminarios 3 y 4. Diseño de cebadores de PCR y problemas sobre PCR. (2h)
Seminarios 5 y 6. Simulaciones de clonaje y mutagénesis dirigida empleando software específico. (2h)

• PRÁCTICAS DE LABORATORIO

PRÁCTICA 1. Purificación de DNA genómico a partir de saliva. Amplificación por PCR de una región del genoma purificado. Generación de vectores de expresión recombinantes mediante ligación de fragmentos de DNA. Transformación bacteriana. (3h).
PRÁCTICA 2. Inoculación de cultivos bacterianos. Análisis de los productos de PCR en geles de agarosa y poliacrilamida nativos. Purificación de DNA plasmídico a partir de cultivos bacterianos. Digestión con enzimas de restricción. Análisis de fragmentos en geles de agarosa de los fragmentos de restricción y de los productos de PCR. Valoración de los resultados obtenidos en los dos apartados (2h).
PRÁCTICA 3. Purificación de DNA plasmídico a partir de cultivos bacterianos. Digestión con enzimas de restricción y análisis de fragmentos en geles de agarosa. Análisis de los resultados (3h).

• TUTORÍAS

Las tutorías de aula se emplearán específicamente para la resolución de dudas relacionadas con los distintos contenidos de la materia. (1h)

• EXAMEN

El examen contendrá distintos tipos de preguntas relacionadas con cualquiera de las actividades realizadas durante el transcurso de la materia. (3h)

Bibliografía básica

-Brown, T.A., 2016. Gene cloning and DNA analysis: An Introduction. 7th ed. Chichester: Wiley-Blackwell.
-Clark, D.P. and Pazdernik, N.J., 2016. Biotechnology. [en liña] 2nd ed. Amsterdam: Elsevier Academic Press. Dispoñible en: https://www-sciencedirect- com.ezbuse.use.gal/book/9780123850157/biotechnology
-Real García, M.D., Rausell Segarra, C. y Latorre Castillo, A., 2017. Técnicas de ingeniería genética. Madrid: Síntesis.

Bibliografía complementaria

-Clark, D.P, 2019. Molecular Biology. [en liña] 3rd ed. Amsterdam: Elsevier. Dispoñible en: https://www-sciencedirect- com.ezbuse.use.gal/book/9780128132883/molecular-biology
-Glick, B.R. and Patten, C.L., 2017. Molecular biotechnology: principies and applications of recombinant DNA. 5th ed. Washington DC: ASM Press.
-Green, M.R. and Sambrook, J., 2012. Molecular cloning: a laboratory manual. 4th ed. 3 v. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
-Renneberg, R., Berkling, V., and Loroch, V., 2016. Biotechnology for beginners [en liña]. Amsterdam: Elsevier. Dispoñible en: https://www-sciencedirect- com.ezbusc.usc.gal/book/9780128012246/biotechnology-for-beginners

Otros recursos

http://biomodel.uah.es. Sitio web Universidad Alcalá de Henares
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/. The National Center for Biotechnology Information, (NCBI) fonte principal de bases de datos (nucleótidos, xenes e xenomas) e ferramentas bioinformáticas.
https://www.jove.com/science-education-library. Vídeos educativos sobre diferentes técnicas de biología molecular e ingeniería genética.
Recursos electrónicos da BUSC: Cell, Nature, Science, Sciencedirect, etc.

• Conocimientos/contenidos: Con01, Con06, Con09.
• Habilidades/destrezas: H/D01, H/D02, H/D03, H/D04, H/D07, H/D08, H/D09, H/D10, H/D11.
• Competencias: Com01, Comp02, Comp03, Comp04, Comp05, Comp06, Comp07

En el apartado CONTENIDOS DE LA MATERIA se indican las duraciones aproximadas de las diferentes actividades presenciales de los/as alumnos/as en el aula o laboratorio.

Las clases expositivas tendrán un formato de de clases magistrales presentadas por el profesor/a responsable, no siendo de asistencia obligatoria para el alumnado, y una duración aproximada de 1h. Se emplearán, además del encerado, presentaciones audiovisuales que estarán disponibles en el curso virtual de la materia, para que sea más fácil el seguimiento de los contenidos. En las clases, los/as alumnos/as pueden interrumpir las explicaciones del profesor con cuestiones o dudas, así como, el profesor podrá hacer preguntas, solicitar la participación de los/as estudiantes en la discusión y presentación de los contenidos y requerir la búsqueda de información para su entrega en la siguiente clase. Las clases teóricas requerirán un seguimiento y dedicación diarios (en el aula y fuera de ella) ya que el profesor presentará los aspectos básicos de la asignatura que han de ser ahondados mediante el manejo de la bibliografía y el estudio. Se trabajarán, en general, todas las competencias y objetivos específicos de la materia, mediante la interrelación de los contenidos y conceptos de la materia, y la familiarización y manejo de las principales fuentes bibliográficas en el campo de la Ingeniería genética y la biotecnología que permitan al/a la alumno/a un seguimiento y ahondamiento en la información recibida en el aula.

Los seminarios constarán de seis sesiones de 1h de duración aproximada en los que se realizarán tareas teórico-prácticas relacionadas con los contenidos de la materia, incluyendo problemas y cuestionarios, algunos de los cuales serán entregados al profesor/a responsable para su evaluación. Los seminarios no son de asistencia obligatoria.

Las prácticas de laboratorio constarán de tres sesiones obligatorias (salvo para los/as repetidores/as que ya las hayan superado) en el laboratorio. Las prácticas son de asistencia obligatoria al 100% (se tomará listado de firmas). Las prácticas consistirán en la realización (y revisión de los contenidos aportados por el profesorado en el Campus Virtual) de algunas de las técnicas básicas en Ingeniería genética y servirán para reforzar y ver la aplicación real de los contenidos mostrados en la teoría. Los/as estudiantes deberán realizar memorias o cuestionarios relacionados con las prácticas que serán calificados por el/la profesor/a responsable como parte de la evaluación continua.

Las tutorías no son de carácter obligatorio y se emplearán para la resolución de dudas relacionados con el resto de contenidos de la materia.

La evaluación constará de dos partes: evaluación continua y prueba final:

Evaluación continua (30% de la calificación final), que a su vez se compone de:

• Seminarios (20% de la calificación final). ACTIVIDAD NO OBLIGATORIA EVALUABLE. La evaluación se basará en los ejercicios/trabajos presentados al profesor o realizados en los seminarios. Se realizarán al menos tres tareas evaluables a lo largo de los 6 seminarios.
• Prácticas de laboratorio (10% de la calificación final). ACTIVIDAD OBLIGATORIA EVALUABLE. Para la evaluación se puntuará la memoria final y/o cuestiones sobre los protocolos explicados. Las ausencias no justificadas o no entregar las tareas evaluables supondrán una calificación de NO APTO. El alumnado deberá obtener una calificación superior a 4 en las prácticas para superar la materia. El control de asistencia a las prácticas se realizará mediante firma.

Prueba final (70% de la calificación final). ACTIVIDAD OBLIGATORIA EVALUABLE COMPLEMENTARIA A LA EVALUACIÓN CONTINUA. Se llevará a cabo de forma presencial y consistirá en un examen con preguntas tipo test, cuestiones y ejercicios relacionados con los contenidos teórico-prácticos de la materia. La calificación será la obtenida ponderando la de la prueba final (es necesario tener una nota mínima de 4 sobre 10 puntos para hacer la ponderación) con la de la evaluación continua. Si no se alcanza la nota mínima en la prueba final, la calificación final en la materia será exclusivamente la nota ponderada del examen.

El alumnado que no supere la materia en la oportunidad ordinaria, podrá presentarse a la prueba final en la oportunidad de recuperación (2ª oportunidad). La nota de la evaluación continua se mantendrá para la oportunidad de recuperación. Aquellos/as alumnos/as que suspendan las prácticas deberán hacer un examen específico de recuperación.

A los/las estudiantes que suspendan la materia, pero tengan aprobadas las prácticas de laboratorio, se les mantendrá esa nota durante el curso siguiente. El alumnado repetidor tendrá el mismo régimen de asistencia a clases interactivas (excepto las prácticas) y el mismo sistema de evaluación que el matriculado por primera vez.

Evaluación de los resultados del aprendizaje:
-Examen: Con01, Con06, Con09, H/D01, H/D03, H/D07, H/D08, H/D11, Comp01, Comp02, Comp06
-Trabajos/ejercicios seminarios: Con01, Con06, Con09, H/D01, H/D04, H/D07, H/D08, H/D09, H/D010, H/D11, Comp03, Comp06
-Prácticas: H/D02, H/D010, H/D11, Comp04, Comp05, Comp07

Para los casos de realización fraudulenta de ejercicios o pruebas será de aplicación lo recogido en la Normativa de evaluación del rendimiento académico de los estudiantes y de revisión de calificaciones.

TRABAJO PRESENCIAL EN EL AULA (Total: 43h)

Clases magistrales: 26h
Prácticas de laboratorio: 8h
Seminarios: 6h
Tutorías en grupos reducidos: 1h
Realización de exámenes: 2h

TRABAJO PERSONAL DEL/LA ESTUDIANTE (Total: 69.5h)

Estudio individual: 49h
Elaboración de las memorias de prácticas y cuestionarios teórico/prácticos: 7h
Preparación de los seminarios: 13.5h

La recomendación más importante es la asistencia, el aprovechamiento de las clases y la realización de las tareas propuestas. Llevar al día la materia, reflexionar sobre los conceptos explicados e intentar profundizar en ellos contribuirán a dominar la materia.

En las pruebas escritas es importante leer atentamente las preguntas, interpretar la lógica de los resultados o las respuestas, emplear un lenguaje preciso y riguroso, y repasar las respuestas.

Aunque no son de realización obligatoria, es muy recomendable asistir y preparar bien los seminarios, cumplimentando aquellas pruebas evaluables que representen. No solo suponen una parte importante de la evaluación final, sino que también permiten repasar la materia de expositivas, y sus contenidos son también materia de examen.

Recordar hacer uso de las tutorías y contactar con el profesorado para resolver cuantas dudas y problemas surjan en el estudio de la materia y hacer seguimiento del aprendizaje.

Para el óptimo aprovechamiento de esta materia, es importante tener una buena base de en asignaturas como Bioquímica I, Biología Molecular, Genética I y II.

Habrá un aula virtual activa de la asignatura a través del Campus Virtual de la USC, que además de para consultar los contenidos de la materia. Para contactar con el profesorado responsable, debéis emplear el correo electrónico institucional, la plataforma MS-Teams, o mensajes a través del foro del Campus Virtual.

Plagio y uso indebido de las tecnologías en la realización de tareas o pruebas: para los casos de realización fraudulenta de ejercicios o pruebas será de aplicación lo recogido en la Normativa de evaluación del rendimiento académico de los estudiantes y de revisión de calificaciones.

También queda terminantemente prohibida la distribución por distintos medios (por ejemplo, en páginas web, distribución a personas ajenas al curso, etc.) sin consentimiento del profesorado, de cualquier material docente disponible en el aula virtual.